Odvzem popkovnične krvi in popkovnice je preprost, neboleč in varen postopek, ki ne vpliva na potek poroda. Kri se odvzame iz popkovnice, ko je otrok že rojen in mati stabilna. Nato se odreže še približno 15 – 20 cm popkovnice. Če se pri porodu pojavijo kakršne koli komplikacije, do odvzema popkovnične krvi ne pride, dokler materino in otrokovo zdravje ni stabilno. Materi po porodu odvzamejo še kri iz vene, da pozneje v laboratoriju ugotovijo njen virološki status (testira se na HIV, TPHA, hepatitis B in C, ter bakterijske in glivne okužbe). Popkovnična in materina kri ter popkovnica se hrani na sobni temperaturi vse do prevzema seta s strani predstavnika Biobanke.